1. Chaosium Sword 2. Twist of Fate II 3. Going Gets Tough 4. Battlefield 5. Robert the Army 6. It's Too Late 7. Dehumanize 8. Interlude II 9. Thunderstorm 10. Overdrive 11. No End Darkness 12. Tower Lahja 13. World Enslaved 14. The Parasprinter 15. Irene Captured 16. The Dark Emperor 17. Hideous Relics 18. Interlude I 19. Fire Cavern 20. Shadow Diabolica 21. To the Rescue 22. Unlimited Moment 23. Castle Demonic 24. Ryu Fights Back 25. Lord of Night 26. Irene & Ryu 27. A Long Way To Go 28. Defeated 29. All Gone
NINJA GAIDEN III: THE ANCIENT SHIP OF DOOM
1. Introduction I 2. Introduction II 3. Introduction III 4. Twist of Fate 5. Stage 1-1 / 5-1 6. Battlefield 7. Cinema Display I 8. Cinema Display II 9. Stage 2-1 / 7-2 10. Cinema Display III 11. Cinema Display IV 12. Stage 2-2 / 5-2 13. Cinema Display V 14. Cinema Display VI 15. Stage 3-1 / 6-2 16. Cinema Display VII 17. Cinema Display VIII 18. Stage 3-2 / 6-1 19. Cinema Display IX 20. Stage 4-1 / 7-1 21. Cinema Display X 22. Stage 4-2 / 7-3 23. Cinema Display XI 24. Cinema Display XII 25. Cinema Display XIII 26. Stage 7-5 / 7-6 27. Epilogue [NGIII] 28. Credits 29. Game Over 30. Twist of Fate (Reprise)
Ninja Gaiden 完全盤サウンドトラックは二部作に分けられており、こちらのVolume 2ではゲームのシリーズ二作目の「忍者龍剣伝II 暗黒の邪神剣」と三作目の「忍者龍剣伝III 黄泉の方船」のサウンドトラックを収録している。（尚、「忍者龍剣伝III 黄泉の方舟」は初の音源化になります。）Volume 1に引き続き山岸が総監修として、「忍者龍剣伝II」の作曲家である新田竜一、「忍者龍剣伝III」の作曲家の半井香織もそれぞれ監修してレストアされている。こちらにも同じく、開発チームや監督を始めとする制作陣のインタビューや、Ray Barnholt氏のエッセイ、オリジナルのアートワークが収録されている。
トラックリストNINJA GAIDEN II: THE DARK SWORD OF CHAOS
1. Chaosium Sword
2. Twist of Fate II
3. Going Gets Tough
4. Battlefield
5. Robert the Army
6. It's Too Late
7. Dehumanize
8. Interlude II
9. Thunderstorm
10. Overdrive
11. No End Darkness
12. Tower Lahja
13. World Enslaved
14. The Parasprinter
15. Irene Captured
16. The Dark Emperor
17. Hideous Relics
18. Interlude I
19. Fire Cavern
20. Shadow Diabolica
21. To the Rescue
22. Unlimited Moment
23. Castle Demonic
24. Ryu Fights Back
25. Lord of Night
26. Irene & Ryu
27. A Long Way To Go
28. Defeated
29. All Gone
NINJA GAIDEN III: THE ANCIENT SHIP OF DOOM
1. Introduction I
2. Introduction II
3. Introduction III
4. Twist of Fate
5. Stage 1-1 / 5-1
6. Battlefield
7. Cinema Display I
8. Cinema Display II
9. Stage 2-1 / 7-2
10. Cinema Display III
11. Cinema Display IV
12. Stage 2-2 / 5-2
13. Cinema Display V
14. Cinema Display VI
15. Stage 3-1 / 6-2
16. Cinema Display VII
17. Cinema Display VIII
18. Stage 3-2 / 6-1
19. Cinema Display IX
20. Stage 4-1 / 7-1
21. Cinema Display X
22. Stage 4-2 / 7-3
23. Cinema Display XI
24. Cinema Display XII
25. Cinema Display XIII
26. Stage 7-5 / 7-6
27. Epilogue [NGIII]
28. Credits
29. Game Over
30. Twist of Fate (Reprise)